Ранее было установлено, что злоупотребляя служебным положением Сергей Чмырь организовал коррупционный механизм, по которому руководители подчиненных ему региональных инспекций платили взятки за решение кадровых вопросов, за пребывание на должности, а также за продолжение сроков госслужбы.

В декабре 2009 года СБУ прекратила коррупционную деятельность Сергея Чмыря, задержав его в одном из ресторанов Киева во время получения очередной взятки в сумме $5 тыс. от подчиненного. В ходе следственных действий, во время обыска рабочего кабинета Сергея Чмыря было изъято еще 150 тыс. грн и $17 тыс.

По решению суда Сергей Чмырь приговорен к лишению свободы сроком на 5 лет с конфискацией имущества, его также лишили первого ранга госслужащего и запретили занимать должности в органах государственной власти и местного самоуправления сроком на 1 год и 6 месяцев.

Однако Апелляционный суд Киева смягчил приговор Сергею Чмырю, освободив его от отбывания основного наказания в колонии, назначив испытательный срок на 2 года, а также исключил ссылку о конфискации имущества осужденного.

Свою мягкость суд объяснил «многолетним трудовым стажем» и особыми заслугами взяточника: Сергей Чмырь награжден орденом Святого Владимира 4 степени, ему присвоено звание Заслуженного работника сельского хозяйства, он также является «носителем» научных степеней — докторской в экономических науках и кандидатской — в сельскохозяйственных.